Oprindelsen af Fuji-æblet kan spores tilbage til 1939, hvor Morioka-grenen af Fruit Tree Experiment Station under Ministeriet for Landbrug, Skovbrug og Fiskeri i Japan hybridiserede Kunimitsu-sorten med Marshal (Red Marshal). Efter 23 år med omhyggelig dyrkning, eksperimenter og regional testning, blev den resulterende sort officielt navngivet Fuji i 1962. Fuji-æblet, der blev skabt i Japan i 1939 ved at krydse Kunimitsu- og Marshal-sorterne og officielt navngivet i 1962, er kendetegnet ved dets sene modning og enestående kvalitet. Fuji-æblet inkorporerer ikke kun mange af forældrenes fremragende egenskaber, men udviser også exceptionelle kvaliteter såsom sen modning, overlegen kvalitet, fremragende smag og lang-opbevaring. På kort tid erstattede Fuji-æblet med succes Kunimitsu-æblet i Japan og blev den mest dyrkede sort på det tidspunkt.

